Der Advanced Pathway Painter ist ein Freeware-Programm zur Visualisierung von Pathways (KEGG, BioCarta, GenMAPP...). Es besteht die Möglichkeit, quantitative Daten aus Gen- bzw. Protein-Experimenten direkt mit den angezeigten Pathways zu verbinden. Dabei werden die jeweiligen Werte in die Pathways eingezeichnet (Farben korrespondieren mit eingestellten Werten). Die Verknüpfung erfolgt über die Gen- oder Protein-Namen bzw. über die jeweilige Accession-Nummer. Darüber hinaus besteht die Möglichkeit einer umfangreichen Informationsgewinnung durch eine vorhandene Internetverlinkung zu den interessierenden Internetdatenbanken. Dieses Programm stellt einen kleinen Teil des Funktionsumfanges der Software GENOM 2005 dar und ist lizenzfrei.